Endotrahheaalne intubatsioon tehakse üldjuhul enne atrahheostoomi toruasetatakse. Mõlemad anendotrahheaalne toruja trahheostoomi toru tagavad juurdepääsu hingamisteedele positiivse rõhuga ventilatsiooniks ventilaatorist. Endotrahheaalset toru kasutatakse tavaliselt lühiajaliseks mehaaniliseks ventilatsiooniks. Endotrahheaalne toru sisestatakse suhu ja läbi häälepaelte, et tagada kopsude ventilatsioon.
Kui endotrahheaalne toru on olnud juba mõnda aega või kui arst arvab, et patsient vajab pikaajalist mehaanilist ventilatsiooni, võib paigaldada trahheostoomi toru. Trahheostoomi toru on toru, mis asetatakse operatsiooni ajal otse hingetorusse krikoidkõhre juures. Toru on häälepaelte tasemest allpool. See on tavaliselt patsiendile mugavam ja võib vähendada sedatsiooni vajadust. Samuti vabastab see ülemised hingamisteed, võimaldades patsiendil kasutada suud rääkimiseks ja neelamiseks.